Produkty //

HNPCC MASTR Plus

OPIS OGÓLNY

HNPCC MASTR Plus to panel genetyczny pozwalający na detekcję wariantów germinalnych typu SNV oraz CNV w czterech genach (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2) a także 3’ UTR genu EPCAM, mających związek z rozwojem dziedzicznego raka jelita grubego niezwiązanego z polipowatością (HNPCC- hereditary non-polyposis colorectal cancer). Aby amplifikacji wskazanych regionów była możliwa, potrzebne  jest minimum 20 ng DNA pozyskanego z krwi, na jedną reakcję mutlipleks PCR. HNPCC MASTR Plus jest kompatybilny z sekwenatorami serii MiSeq.

HNPCC MASTR Plus wykorzystuje innowacyjną  technologię MASTR, dzięki której przygotowanie bibliotek NGS, odbywa się z zastosowaniem 2-stopniowej  reakcji multipleks PCR.  Pierwszy etap to amplifikacja regionów z udziałem specyficznych primerów. Drugi etap przebiega z wykorzystaniem uniwersalnych starterów pozwalający na inkorporacje adapterów kompatybilnych z danymi systemami do sekwencjonowania oraz sekwencji znakujących (MID) mających na celu rozróżnienie pochodzenia poszczególnych odczytów z puli.

SPECYFIKACJA TECHNICZNA


Analizowane geny MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, 3’UTR dla EPCAM
Wielkość analizowanego regionu 20 kb
Liczba amplikonów 84
Długość amplikonów 277 – 443 pz
Liczba reakcji multiplekx PCR 5
Kompatybilny z sekwenatorami MiSeq oraz Ion PGM
Liczba próbek na run MiSeq V2 : 670, MiSeq V3 : 1229

DODATKOWE INFORMACJE

Jeden zestaw pozwala na przygotowanie 24 próbek.

Startery uniwersalne pozwalające na inkorporację sekwencji znakujących oraz adapterów, zamawiane są osobno.

– drMID Dx dla systemów Illumina – kompatybilne z panelami diagnostycznymi CE-IVD

– drMID dla systemów Illumina – kompatybilne z panelami RUO

– MID dla Ion PGM – kompatybilne z sekwenatorami IonTorrent

 

 

ZAMÓW