Produkty //

GIST MASTR

OPIS GŁÓWNY

GIST MASTR to panel który został zaprojektowany z myślą o detekcji mutacji somatycznych typu SNV w wybranych eksonach genu KIT (eksony 9,11,13,14,15,16,17) oraz PDGFRA (eksony 8,10,12,14,18). Geny KIT oraz PDGFRA uznaje się z mające związek z rozwojem nowotworów podścieliskowych przewodu pokarmowego (GIST – gastrointestinal stromal tumors). Zestaw umożliwia amplifikację wskazanych regionów, w dwóch reakcjach multipleks PCR, przy wykorzystaniu zaledwie 4 ng DNA (na jedną reakcję) pozyskanego z krwi lub próbek typu FFPE. Sekwenatory MiSeq Illumina oraz PGM oraz S5 IonTorrent są kompatybilnymi systemami.

GISTR MASTR wykorzystuje innowacyjną  technologię MASTR, dzięki której przygotowanie bibliotek NGS, odbywa się z zastosowaniem 2-stopniowej  reakcji multipleks PCR.  Pierwszy etap to amplifikacja regionów z udziałem specyficznych primerów. Drugi etap przebiega z wykorzystaniem uniwersalnych starterów pozwalający na inkorporacje adapterów kompatybilnych z danymi systemami do sekwencjonowania oraz sekwencji znakujących (MID) mających na celu rozróżnienie pochodzenia poszczególnych odczytów z puli.

SPECYFIKACJA TECHNICZNA


Analizowane geny KIT (exony 9, 11, 13, 14, 15, 16, 17) & PDGFRA (exony 8, 10, 12, 14, 18)
Liczba amplikonów 17
Długość amplikonów 120 -220 pz
Liczba reakcji multiplex PCR 2
Kompatybilność z sekwenatorami Illumina MiSeq, Ion PGM I S5

DODATKOWE INFORMACJE

Jeden zestaw pozwala na przygotowanie 24 próbek.

Startery uniwersalne pozwalające na inkorporację sekwencji znakujących oraz adapterów, zamawiane są osobno.

– drMID Dx dla systemów Illumina – kompatybilne z panelami diagnostycznymi CE-IVD

– drMID dla systemów Illumina – kompatybilne z panelami RUO

– MID dla Ion PGM – kompatybilne z sekwenatorami IonTorrent

ZAMÓW